模板网站和定制网站最大区别是：定制网站具有风格和功能的随意性和可修改性，模板网站却大多是套用一种模式不能开展网络营销，所有企业都必须套用系统设置好的一个网站模板，而模板库里面供参考的不过几十种方案。如果想把内容变化位置，或按自己的企业特色更改风格，都是不能做到的。模板网站系统如做好的模型，选择一个模型然后生成网站。
模板建站的优点
模板自助建站是通过使用模板和内容管理系统来建设及更新网页。使得制作与维护都变得容易起来。许多主机服务提供商都提供自助产品，与主机服务捆绑销售。敲敲键盘选择一下，然后表单、地图、留言板、日历等诸多基本元素就自动生成了。
定制网站的优点：
程序开发较自由，能够充分发挥网站开发人员的能力，使建成后的网站更具个性化，安全性、稳定性更好，同时，也使网站具有更强的扩展性， 网站便于推广。
缺点：
(1) 不能灵活地扩展网站功能 由于建站、管理和维护工作必须在服务商的网站上完成，因此用户的网站也被捆绑在该公司的服务器上，用户网站不能自由地移植，限制了用户自由选择的权利。
(2) 不能自由地移植用户网站 模板建站工具的功能模块是固定提供的，用户不能对其进行剪裁、或设置、或组合，更谈不上对其进行二次开发，或自由地导入自己开发的网站功能模块。
(3) 最主要的缺点：绝大部分的自助建站都没有从营销的角度来建设，而且速度慢等问题让网站很难推广。而且自助建站系统是非常不利于排名。一个采用自助建站 系统建设的企业网站，即使被百度、Google、雅虎、搜狗等搜索引擎收录了很多页面，但其排名也是非常落后的，达不到应有的公司产品宣传、推广效果。
(4) 不能随意地编辑网页模板
对于选用的网站模板，用户无法对其进行独立、随意地编辑，更不能导入自定义的模板，利用这样的技术制作网站，往往是一个呆板而雷同的网站，难以让人接受。
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